... und zweitens kostet es sicher einige Schiffe.
Nein, tut es in den wenigsten Fällen. Ich habe ehemals exzessiv diese PN ausgeräuchert und - solange die Schiffe voll bewaffnet waren - sind sie auch zurückgekehrt. Ich habe damals per Autokampf kämpfen lassen.
Edit: Ich habe grundsätzlich mit 7 Schiffen angegriffen: Koggen, Holke oder eine Mischung dieser beiden. Matrosen voll (natürlich), Entermesser auf das nächste Vielfache von 5 aufgerundet. Kanonen, Bombarden, Werke, Bliden ... was grad da war, "chaotisch" sozusagen.
Ein zweiter Angriff sollte nicht möglich sein.
In wenigen Fällen konnte ich ein PN 2nal angreifen. Die können jedoch auch zufällig an gleicher Stelle generierte PN gewesen sein.
Den Tipp vorher zu speichern und vorzuspulen, kann ich vorbehaltslos unterschreiben.
Ich auch.
... Kann es ein entwicklungsfehler sein?
Wohl eher ein seltener Bug. Falls du hast, nimm einen älteren Spielstand.